Mazowiecki Szpital Bródnowski może poszczycić się wysokim poziomem opieki nad matką i noworodkiem. Oddziały Neonatologii oraz Położnictwa MSB posiadają najwyższy – trzeci – stopień referencyjności, co oznacza, iż specjalizują się w prowadzeniu ciąż wysokiego ryzyka oraz opiece nad noworodkami wymagającymi zaawansowanego leczenia i nadzoru medycznego.